Vikipediya

Rev (HIV) oqsili

Rev - transaktivlovchi oqsil bo'lib, OIV-1 (va boshqa lentiviral) oqsil ifodasini tartibga solish uchun zarurdir. Yadro lokalizatsiyasi signali rev genida kodlangan bo'lib, bu Rev oqsilini yadroga lokalizatsiya qilishga imkon berib keladi, u yerda u qo'shilmagan va to'liq bo'lmagan mRNKlarni eksport qilishda ishtirok etadi. Rev yo'q bo'lganda, OIV-1 kech (tuzilish) genlarining mRNKlari yadroda saqlanib qoladi va ularning tarjimasini oldini oladi.

Tarixi tahrir

Gag va env mRNKni tarjima qilishda yangi protein ishtirok etganligi aniqlandi. Noma'lum protein tartibga soluvchi ketma-ketliklarning repressiyalarini olib tashlash orqali ishladi va Art (repressiyaga qarshi transaktivator) deb nomlandi[1]. Keyinchalik tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, oqsil RNKni birlashtirish mexanizmini tartibga solishda ishtirok etgan. Shuning uchun oqsilning nomi Art dan Trs (splaycing transregulyatori) ga o'zgartirildi[2]. Eng so'nggi tadqiqotlar shuni ko'rsatdiki, oqsil OIV-1 oqsillarini tartibga solishda bir nechta funksiyalarga ega va uning nomi Rev (virion oqsillarini ifodalash regulyatori) ga o'zgartirildi, bu esa uning funksiyasini umumiy tarzda tavsiflab beradi[3].

Tuzilishi tahrir

Rev 116 aminokislotadan tashkil topgan 13 k Da protein hisoblanadi[4][5]. Revning ketma-ketligi yadroviy import va eksportga hissa qo'shadigan ikkita maxsus domenni o'z ichiga oladi. Protein odatda tetramer vazifasini bajaradi. 

Argininga boy motiv tahrir

Revning N-terminal hududida argininga boy ketma-ketlik mavjud. Argininga boy motiv (ARM) rev genining[6] 38-49 aminokislotalari orasida joylashgan va alfa-spiral ikkilamchi tuzilmani hosil qiladi[7]. ARM juda o'ziga xos ketma-ketlik bo'lib, RNK bilan bog'lanishdan oldin Rev oqsillarini multimerizatsiya qilishga imkon beradi. Yagona bazani almashtirish Revning tetramer hosil qilish qobiliyatini o'zgartiradi[8]. Revning argininga boy domeni env genining quyi oqimida joylashgan OIV Rev javob elementi (RRE) tarkibiga kiruvchi rev-bog'lovchi element (RBE) bilan o'zaro ta'sir qiladi[9]. Alfa-spiral ikkilamchi strukturani, xususan, spiral-loop-spiral motivi deb hisoblash mumkin, bu REV oqsilining ribonukleoprotein kompleksini hosil qilish uchun RRE RNK bilan barqaror bog'lanishiga imkon beradi[10]. Domen yadroviy lokalizatsiya signalini ham o'z ichiga olgan[11].

 
IIB bog'lash joyining ikkilamchi tuzilishi G47 (magenta)-A73 (to'q sariq) va G48-G71 (magenta) kanonik bo'lmagan tayanch juftlarini ko'rsatadi. Bo'rtib ketgan, juft bo'lmagan uridin nukleotid ikkilamchi spiraldan tashqariga qaraydi (qizil rang). mRNK murakkab katlamali (PDB 4PMI) poyaga o'xshash tuzilmani hosil qiladi.

Revning RREga bog'lanishi tahrir

Rev-javob elementi (RRE) OIV-1 genomining ikkinchi intronida, env genining darhol quyi oqimida joylashgan 240 ta tayanch-juft ketma-ketlikdir[12]. RRE o'zgartirilsa, funktsional bo'lib qoladi, lekin bir xil yo'nalishda qolishi kerak (teskari aylantirilishi mumkin emas). RRE to'liq ishlov berilmagan mRNK transkriptlari tomonidan saqlanadi. RRE ning ikkilamchi strukturasi sakkizta poyali halqa hosil qiladi. Rev dastlab puringa boy boʻlgan IIB poya halqasi bilan bogʻlanadi[13], soʻngra I novdasidagi ikkilamchi joy bilan bogʻlanadi[14].

 
RNK bilan bog'lanish (PDB 4PMI) paytida urasil 66 (qizil), guanin 67 va guanin 70 (magenta) qoldiqlari bilan maxsus aloqa qiladigan Arg35 va Arg39 qoldiqlari (IUPAC standartlariga ega element bilan ranglangan) ko'rsatilgan.

ARM R35 va R39 qoldiqlarini o'z ichiga oladi, ular RRE mRNKdagi qoldiqlar bilan, xususan, mos ravishda urasil 66, guanin 67 va guanin 70 asoslari bilan bevosita aloqa qiladi. Ushbu asoslarning qarama-qarshi tomonida N40 va R44 qoldiqlari urasil 45, guanin 46, guanin 47 va adenin 73 nukleotidlari bilan bazaga xos aloqalarni hosil qiladi. Ushbu barqarorlashtiruvchi kontaktlarga qo'shimcha ravishda, ARM ichidagi qo'shimcha Arg qoldiqlari, shuningdek, T34 mRNKdagi asoslar bilan o'ziga xos bo'lmagan kontaktlarni amalga oshiradi[15].

 
Uratsil 45 (qizil), guanin 46 (magenta), guanin 47 (magenta) va adenin 73 (to'q sariq) (PDB 4PMI) qoldiqlari bilan maxsus aloqa qiladigan N40 va R44 qoldiqlari (IUPAC standartlariga ega element bilan ranglangan) ko'rsatilgan.

RRE ketma-ketligi cis ta'sir qiladi va sitoplazmada env mRNKning yuqori darajasiga erishish uchun zarur hisoblanadi[16]. RRE shuningdek, Rev bilan bog'lanishi va ishlashi uchun zarur bo'lgan Rev oqsillarining multimerizatsiyasini osonlashtirib beradi[17]. Rev oqsili qoʻshilmagan gag va pol transkriptlarini hamda toʻliq boʻlmagan env, vif, vpr va vpu transkriptlarini RREda bogʻlab, sitoplazmaga eksport qilishni osonlashtiradi[18].

Yadrodan genomik eksport tahrir

Rev doimiy ravishda sitoplazma va yadro o'rtasida joylagan bo'ladi. Rev ning harakatlanishi yadroviy lokalizatsiya signali va yadroviy eksport signali bilan tartibga solinadi. Rev yadro ichiga kirgandan so'ng, Ran-YaIM Ran-GTP ga fosforlanadi, bu esa import kompleksining parchalanishiga olib keladi. Demontajdan so'ng, Rev's NES to'liq bo'lmagan transkriptlar ichida RRE ketma-ketligida CRM1 (eksport -1) va Ran -GTP bilan yangi kompleks hosil qiladi. Kompleks yig'ilgandan so'ng, intron o'z ichiga olgan RNKlar yadrodan sitoplazmaga eksport qilinadi[19]. Pre-mRNKlar sitoplazmada bo'lgandan so'ng, Rev ajralib chiqadi va NLSni ochadi[20]. NLS ta'siri, Revni yadroga qaytarish uchun importin -b bilan Rev o'zaro ta'siriga imkon beradi. 

Manbalar tahrir

  1. ↑ "A second post-transcriptional trans-activator gene required for HTLV-III replication". Nature 321 (6068): 412–7. May 1986. doi:10.1038/321412a0. PMID 3012355. 
  2. ↑ "HTLV-III expression and production involve complex regulation at the levels of splicing and translation of viral RNA". Cell 46 (6): 807–17. September 1986. doi:10.1016/0092-8674(86)90062-0. PMID 3638988. 
  3. ↑ "HIV/HTLV gene nomenclature". Nature 333 (6173): 504. June 1988. doi:10.1038/333504a0. PMID 2836736. 
  4. ↑ "The human immunodeficiency virus rev protein is a nuclear phosphoprotein". Virology 171 (1): 264–6. July 1989. doi:10.1016/0042-6822(89)90535-7. PMID 2741343. 
  5. ↑ "HIV Rev self-assembly is linked to a molten-globule to compact structural transition". Biophysical Chemistry 108 (1–3): 101–19. March 2004. doi:10.1016/j.bpc.2003.10.013. PMID 15043924. 
  6. ↑ "Specific binding of a basic peptide from HIV-1 Rev". The EMBO Journal 11 (3): 1119–29. March 1992. doi:10.1002/j.1460-2075.1992.tb05152.x. PMID 1547776. PMC 556554. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=556554. 
  7. ↑ "The ins and outs of HIV Rev". Archives of Biochemistry and Biophysics 365 (2): 186–91. May 1999. doi:10.1006/abbi.1999.1207. PMID 10328811. 
  8. ↑ "Oligomerization and RNA binding domains of the type 1 human immunodeficiency virus Rev protein: a dual function for an arginine-rich binding motif". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 88 (17): 7734–8. September 1991. doi:10.1073/pnas.88.17.7734. PMID 1715576. PMC 52377. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=52377. 
  9. ↑ "HIV Rev self-assembly is linked to a molten-globule to compact structural transition". Biophysical Chemistry 108 (1–3): 101–19. March 2004. doi:10.1016/j.bpc.2003.10.013. PMID 15043924. 
  10. ↑ Auer, Manfred; Gremlich, Hans Ulrich; Seifert, Jan Marcus; Daly, Thomas J.; Parslow, Tristram G.; Casari, Georg; Gstach, Hubert (1994-03-15). "Helix-Loop-Helix Motif in HIV-1 Rev" (en). Biochemistry 33 (10): 2988–2996. doi:10.1021/bi00176a031. ISSN 0006-2960. PMID 7510518. https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/bi00176a031. 
  11. ↑ "Transport of macromolecules between the nucleus and the cytoplasm". RNA 4 (4): 351–64. April 1998. PMID 9630243. PMC 1369623. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=1369623. 
  12. ↑ "The rev (trs/art) protein of human immunodeficiency virus type 1 affects viral mRNA and protein expression via a cis-acting sequence in the env region". Journal of Virology 63 (3): 1265–74. March 1989. doi:10.1128/JVI.63.3.1265-1274.1989. PMID 2783738. PMC 247823. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=247823. 
  13. ↑ "Evaluation of mismatch-binding ligands as inhibitors for Rev-RRE interaction". Bioorganic & Medicinal Chemistry 14 (15): 5384–8. August 2006. doi:10.1016/j.bmc.2006.03.038. PMID 16603366. 
  14. ↑ "A solution to limited genomic capacity: using adaptable binding surfaces to assemble the functional HIV Rev oligomer on RNA". Molecular Cell 31 (6): 824–34. September 2008. doi:10.1016/j.molcel.2008.07.016. PMID 18922466. PMC 2651398. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=2651398. 
  15. ↑ Rausch, Jason; Grice, Stuart (June 2015). "HIV Rev Assembly on the Rev Response Element (RRE): A Structural Perspective". Viruses 7 (6): 3053–3075. doi:10.3390/v7062760. PMID 26075509. PMC 4488727. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=4488727. 
  16. ↑ "Regulation of human immunodeficiency virus env expression by the rev gene product". Journal of Virology 63 (5): 1959–66. May 1989. doi:10.1128/JVI.63.5.1959-1966.1989. PMID 2704072. PMC 250609. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=250609. 
  17. ↑ "Oligomerization and RNA binding domains of the type 1 human immunodeficiency virus Rev protein: a dual function for an arginine-rich binding motif". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 88 (17): 7734–8. September 1991. doi:10.1073/pnas.88.17.7734. PMID 1715576. PMC 52377. //www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=52377. 
  18. ↑ "Effect of Rev on the intranuclear localization of HIV-1 unspliced RNA". Virology 249 (2): 286–96. September 1998. doi:10.1006/viro.1998.9312. PMID 9791020. 
  19. ↑ "Viral RNA export". Chemistry & Biology 4 (5): 335–44. May 1997. doi:10.1016/s1074-5521(97)90124-1. PMID 9195877. 
  20. ↑ "Functional similarity of HIV-I rev and HTLV-I rex proteins: identification of a new nucleolar-targeting signal in rev protein". Biochemical and Biophysical Research Communications 162 (3): 963–70. August 1989. doi:10.1016/0006-291x(89)90767-5. PMID 2788417.  
"https://uz.wikipedia.org/w/index.php?title=Rev_(HIV)_oqsili&oldid=3104672" dan olindi